雨季對污水管道帶來的影響還有夾雜的泥沙較多，雨水和污水疊加后導致管網水量增大，泥沙雜質，砂石都卷入污水廠內，增加污水處理廠的無機負荷壓力，強沖刷使得原來裸露在地面的植被，揚塵都沖入地下管道，使得管道存在被淤泥堵塞的情況，需要及時清理保障管網通暢。

       在雨季污水處理廠的水位基本已達到超過設計水量標準，隨著流量增大，水泵的提升流量超過日常提升水量，污水處理廠的各個環節停留時間短，使污水處理廠處于超負荷運轉狀態。

       污水中泥沙的增加，對原來的污水的水質結構改變，比如雨水進入導致酸性PH值改變，雨水進入，加大了空氣中的氧氣，進入管道提高了污水的DO值，空氣中的氮和氨氮也會在降雨中進入污水管道，造成污水的氨氮值升高，路面的污水進入導致污水處理的重金屬超標。

       雨季來臨，一方面要控制進水量，通過調小提升泵出水閥門控制水量，使雨季的進水量和平時進水保持一致，多余水量通過溢流管路流出場外，保持處理中的水量在平穩的狀態下運行。另一方面控制泥沙含量，用吸砂泵在沉淀池中抽泥，提升水和泥的分離。還可預先調整微生物的濃度，進水濃度的降低給予后期的進水水質突降有一個緩沖，整體可以平緩度過水質的變動。